Page 204 - Movet - Laboratoriokäsikirja 2015

DNA-tunniste ja polveutuminen (B)
Polveutumistutkimuksessa selvitetään DNA-tunnistei- den avulla jälkeläisen oikeat vanhemmat. Esimerkiksi ti- lanteessa, jossa on tapahtunut kaksoisastutus, täytyy polveutuminen selvittää, sillä syntyneessä pentueessa saattaa olla pentuja useammalta isältä. Suomen Kennel- liitto vaatii polveutumistulokset kaksoisastutuksissa tai tilanteissa, joissa on syytä epäillä että rekisterissä eivät olekaan koiran oikeat vanhemmat. Polveutumistutkimus tehdään kennelliiton vaatimalla ISAG standardin (ISAG = International Society of Animal Genetics) mukaisella me- netelmällä, jossa vanhempien ja jälkeläisten mikrosatel- liittitietoja verrataan toisiinsa. Vastauksessa annetaan jo- kaisen eläimen mikrosatelliittidata sekä jälkeläisten osalta tulkinta kuka tutkituista on tai ei ole tutkittujen vanhempi- en jälkeläisiä.
Miten virallinen näyte otetaan
Koirat
Näytteenottajan tulee olla virallinen Suomen Kennelliiton hyväksymä näytteenottaja. Movet-laboratorion työntekijät ovat kaikki Suomen Kennelliiton hyväksymiä näytteenot- tajia. Näytteenottaja tarkastaa jokaista virrallista näytettä ottaessaan tunnistemerkinnän (mikrosiru), jotta voidaan varmistaa, että kyseessä on oikea eläin. Lähetteenä käy- tetään AINA Suomen Kennelliiton polveutumistutkimus- lomaketta, sekä Movetin omaa lähetettä. Mikäli isäeh- dokkaita on eri puolilla Suomea, ja näytteitä lähetetään erillään pentujen ja emän näytteistä, tulee isäehdokkaalle täyttää Suomen Kennelliiton DNA-tunnistelähete. Tämän lisäksi isäehdokkaiden tietojen tulee olla selkeästi mer- kittyinä polveutumislomakkeeseen. Suomen Kennelliiton lomakkeessa tulee olla kaikkien osapuolien allekirjoituk- set. Niiden puuttuessa, ei tutkimuksen katsota olevan vi- rallinen. Nämä molemmat lomakkeet tulee lähettää myös tutkivaan laboratorioon. Laboratorio lisää tuloslomakkee- seen maininnan tunnisteen tarkistaneesta henkilöstä. Mo- vet vastaa tulokset omistajalle, eläinlääkärille, sekä lähet- tää tiedot kennelliittoon (rekisterointi@kennelliitto.fi). Jos et halua polveutumistulosten lähtevän Suomen Kennelliit- toon, mainitse asiasta selkeästi mahdollisimman mones- sa kohdassa!
Kissat
Myös kissaliitolta löytyy oma lomakkeensa geenitestejä ja polveutumismääritystä varten, mutta sen käyttö ei ole pakollista. Polveutumismäärityksiä varten suosittelemme käyttämään Movetin omaa lähetettä, johon mahtuu use- amman eläimen tiedot tai täyttämään kissojen tiedot suo-
raan sähköiselle lähetteelle. Tällöin jokaisen eläimen tie- dot kirjataan erilliselle lähetteelle ja lisätietoihin merkitään onko kyseessä pentu, emo vai isäehdokas.
Näytteet
Näytteeksi suosittelemme aina ensisijaisesti verinäytettä, jol- la saadaan riittävä määrä DNA:ta. Näytteet merkitään selkeästi, esim. mikrosirunumerolla. Mikäli verinäytteen saanti on mahdo- tonta, otamme vastaan myös poskisoluharjanäytteitä (3kpl/eläin). Verinäytteistä on aina saatu riittävästi DNA:ta polveutumistutki- mukseen. Poskisoluharjanäytteissä DNA:n määrä ollut joskus niin vähäinen, että eläimestä on pitänyt ottaa uudet näytteet, mikä luonnollisesti viivästyttää polveutumistuloksen saantia sekä eläin- ten rekisteröintiä. Näytteet otetaan aina emästä, pennusta, sekä kaikista isäehdokkaista. Mikäli emä/isä on kuollut, voidaan polveu- tumista yrittää selvittää lähisukulaisten (esim. isovanhempien) avul- la. Tällaisissa tapauksissa ole yhteydessä laboratorioon ja varmista onko näyte soveltuva. Mikäli jostain vanhemmasta on jo aikaisem- min tutkittu ISAG standardin mukaiset DNA-tunnisteet, ei uutta näytettä tarvitse lähettää. Ilmoita laboratoriolle aiemmin tehdystä tutkimuksesta sähköpostitse (tutkimuksen tehneen laboratorion nimi, milloin tutkimus on tehty, eläimen siru- ja rekisteritiedot), niin pystymme pyytämään satelliittidatan sen tutkineelta laboratoriolta.
Vastausaika:
2–3 vk.
Näytetyyppi:
Suosittelemme EDTA-kokoverinäytettä, jossa DNA-määrä on var- masti riittävä. Otamme vastaan myös poskisolunäytteitä (aina 3 poskisoluharjaa/eläin).
Menetelmä:
DNA-tekniikat (PCR, sekvensointi, qPCR) yhteistyölaboratoriossa.
ISAG-standarin mukaiset markkerit koiralle:
AHTk211, CXX279, REN169O18, INU055, REN54P11, INRA21, AHT137, REN169D01, AHTh260, AHTk253, INU005, INU030, Amelogenin, FH2848, AHT121, FH2054, REN162C04 AHTh171, REN247M23, AHTH130, REN105L03, REN64E19.
ISAG-standardin mukaiset markkerit kissalle:
FCA069, FCA075, FCA105, FCA149, FCA220, FCA229, FCA310, FCA441, FCA678, Amelogenin, FCA026, FCA201, FCA293, FCA453, FCA649
Lisätietoa:
http://www.kennelliitto.fi/kasvatus-ja-terveys/koiran-rekisterointi/ polveutumistutkimus-vahvistaa-oikeat-vanhemmat
Movet Laboratoriokäsikirja | 204