Page 85 - BUKU AJAR ASAM NUKLEAT
P. 85
biasanya mengikuti asilat semuanya. Struktur semua aminoasil-tRNA sintetase E. coli telah ditentukan. Para peneliti telah membagi mereka menjadi dua kelas berdasarkan perbedaan substansial dalam struktur primer dan tersier dan mekanisme reaksi; kedua kelas ini sama di semua organisme.
Proofreading oleh Aminoasil-tRNA Sintetase. Asilasi amino tRNA menyelesaikan dua ujung: (1) aktivasi asam amino untuk pembentukan ikatan peptida dan (2) pengikatan asam amino ke tRNA adaptor yang memastikan penempatan yang tepat dari asam amino dalam polipeptida yang sedang tumbuh. Identitas asam amino yang melekat pada tRNA tidak diperiksa pada ribosom, jadi perlekatan asam amino yang benar ke tRNA sangat penting untuk ketepatan sintesis protein. Selain proofreading setelah pembentukan intermediet aminoasil-AMP, sebagian besar aminoasil-tRNA sintetase juga dapat menghidrolisis ikatan ester antara asam amino dan tRNA dalam aminoasil-tRNA. Hidrolisis ini sangat dipercepat untuk tRNA yang diisi secara tidak benar, menyediakan filter ketiga untuk meningkatkan ketepatan proses keseluruhan.
Sintesis protein dimulai pada ujung terminal amino dan dilanjutkan dengan penambahan bertahap asam amino ke ujung terminal karboksil polipeptida yang sedang tumbuh. Kodon inisiasi AUG dengan demikian menentukan residu metionin terminal amino. Meskipun metionin hanya memiliki satu kodon, (5’)AUG, semua organisme memiliki dua tRNA untuk metionin. Satu digunakan secara eksklusif ketika (5’)AUG adalah kodon inisiasi untuk sintesis protein. Yang lain digunakan untuk mengkode residu Met dalam posisi internal dalam polipeptida. Perbedaan antara AUG awal (5’) dan internal sangat mudah. Pada bakteri, dua jenis tRNA spesifik untuk metionin adalah tRNAMet dan tRNAfMet. Asam amino yang tergabung sebagai respons terhadap kodon inisiasi (5’)AUG adalah N-formil-metionin (fMet). Ia tiba di ribosom sebagai N-formylmethionyl-tRNAfMet (fMet-tRNAfMet), yang terbentuk dalam dua reaksi berturut-turut.
Transformilase lebih selektif daripada sintetase Met-tRNA; itu khusus untuk residu Met yang melekat pada tRNAfMet, mungkin mengenali beberapa fitur
78
