Page 63 - BUKU REFERENSI KLONING GEN

Optimasi pemotongan parsial DNA kromosom S. typhimurium oleh enzim Sau3AI pada penelitian ini diperoleh kondisi waktu inkubasi 30 menit dengan aktivitas enzim Sau3AI 0,5 unit/μg DNA kromosom. Hasil pemotongan DNA kromosom dengan enzim restriksi Sau3AI dielektroforesis pada gel agarosa dengan DNA 𝜆𝜆/HindIII digunakan sebagai standar ukuran DNA Fragmen DNA yang berukuran 4-5 kb pada gel agarosa dipotong dan selanjutnya dimurnikan, hasilnya dapat dilihat pada gambar 4. 4.
Penggunaan enzim restriksi Sau3AI pada pembuatan koleksi genom karena Enzim Sau3AI memiliki 4 basa sisi pengenal, sehingga enzim tersebut dapat mengenali satu kali setiap 256 nukleotida. Oleh karena itu enzim Sau 3AI dapat mengenali lebih banyak sisi pemotongan pada DNA kromosom dibandingkan dengan enzim restriksi yang memiliki Iebih dari 4 basa sisi pengenal.
63