Page 16 - E-Book Molecular Docking

B
2 A

B

Preparasi 2
Preparasi

Tahap awal penambatan molekul dalam penelitian ini adalah preparasi
stuktur makromolekul protein. Fungsi preparasi struktur yaitu menyiapkan

protein reseptor sebelum dilakukan docking. Hal ini diperlukan untuk
memisahkan makromolekul yang diinginkan dari ligand aslinya dan residu-

residu molekul yang tidak diinginkan. Preparasi struktur tersebut dimulai
dengan mengunduh struktur pdb makromolekul dari situs web Protein
Data Bank dengan alamat situs http://www.rcsb.ord/pbd/. Makromolekul

protein yang akan diunduh adalah protein SGLT2, dengan kode PDB 7VSI.

A. Koleksi Struktur 3D Dari Protein Target
A. Koleksi Struktur 3D Dari Protein Target

pada database Protein Data Bank (PDB) (http://www.rcsb.org/).
1. Mengakses struktur 3D protein SGLT2, dengan kode PDB 7VSI

7

Mengetik protein
kode (7VSI) pada
kolom pencarian

Tampilan website PDB

Molecular Docking 15
Molecular Docking