Page 70 - E-book Molecular Docking
P. 70
RANGKUMAN
RANGKUMAN
Molecular docking merupakan simulasi secara
komputasi yang digunakan untuk mencari suatu
pola interaksi antara dua molekul yang paling tepat,
yakni antara makromolekul (obat atau ligan) dan
mikromolekul (reseptor atau protein), sehingga
didapatkan senyawa yang berpotensi menjadi obat
baru yang lebih efektif.
Manfaat dari metode molecular docking adalah
: dapat memudahkan percobaan di laboratorium,
meminimalisir biaya yang dikeluarkan, menghemat
waktu, meminimalisisr faktor trial and error.
Secara umum proses docking dilakukan melalui
tiga tahap, yakni preparasi, docking, dan visualisasi.
Menganalisis hasil docking dapat dilakukan dengan
: Membandingkan skor binding affinity,
membandingkan binding site interaksi protein
target dengan ligand, mengetahui residu asam
amino apa saja yang berinteraksi dengan senyawa
dan jenis interaksinya.
Molecular Docking 69
Molecular Docking