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El arsenal oculto de los billones de microbios

que habitan nuestro cuerpo y que comemos

POR RAÚL LIMÓN

reí que era el principio de una nueva etapa y casi es
el final”, admite apesadumbrado Manuel Carrasco,
empleado en servicios municipales en Sevilla de 59
Caños. Entró en el hospital a principios del verano
para que le retiraran una sonda tras un tratamiento oncoló-
gico.
En cuestión de horas, una sepsis, una reacción extrema a
una infección generada en esa simple intervención, le llevó a
la UCI.
Un mes después dejó el hospital tras sufrir amputaciones de
los dedos por los efectos del ataque, que no respondió inicial-
mente a los tratamientos convencionales.
Evitar estas afecciones y las 700.000 muertes que la Orga-
nización Mundial de la Salud calcula que se producen cada
año por bacterias resistentes a los antibióticos es una carrera
contra el reloj para la que dos investigaciones publicadas en
Cell han abierto nuevas vías que están en nuestro interior: los
microbios con los que convivimos (39 billones) y los que vienen
con los alimentos cotidianos.
Todos cuentan con un arsenal desconocido que utilizan para
residir, interactuar y defenderse. Y esas armas pueden ser
muy útiles.
César de la Fuente, biotecnólogo español de 38 años que
dirige un laboratorio con su nombre en la Universidad de
Pensilvania, lleva toda su vida investigadora rebuscando
antibióticos eficaces que reemplacen a los existentes, frente a
los que las bacterias aprenden a resistir.
Ha hallado moléculas potenciales en nuestros antepasa-
dos, los neandertales, en especies extintas, como el mamut, y
casi un millón de antibióticos nuevos en el microbioma global,
según artículo reciente publicado en Cell.
Una nueva investigación en colaboración con la profesora
Ami Bhatt y su equipo en Stanford, publicada también por
Cell, ha acercado la búsqueda hasta nosotros mismos y explo-
rado nuestra piel y nuestro sistema digestivo, que son hábi- Recreación de algunos de los billones de microorganismos que habitan los intestinos.THOM LEACH / SCIENCE PHOTO
tats naturales para ese universo microscópico. LIBRA (GETTY IMAGES/SCIENCE PHOTO LIBRA)
“En nuestro cuerpo existen billones de microbios compitiendo
por espacio, obligados a atacarse y defenderse para sobrevivir farmacias que producen compuestos que pueden beneficiar al fermentadas y el 5% de carnes fermentadas.
en un entorno extremadamente hostil. Es una guerra química ser humano”, explica. Además de las aplicaciones para mejora de los productos
en la que los protagonistas son los microbios. Pensamos que “Otra cosa interesante es que vimos que las moléculas pueden alimenticios, los investigadores destacan que, comprender
este entorno es propicio para la innovación, permitiendo que modular comunidades de bacterias beneficiosas. Creemos que el microbioma de los alimentos, puede beneficiar la salud
los microbios produzcan nuevos compuestos”, explica por telé- podrían actuar en el microbioma humano para reprogramar humana de forma directa porque algunos de los microbios
fono poco antes de dar una conferencia sobre sus hallazgos estas comunidades”, añade. que comemos pueden convertirse en miembros estables de
en Florencia (Italia), donde también ha sido galardonado con Microbios en los alimentos nuestro propio cuerpo.
el Premio Bodanszky. Al igual que sucede con los fragmentos El estudio de César de la Fuente se ha adelantado a otro, De la Fuente resalta la importancia de estos estudios,
de ADN que inicialmente se consideraban inútiles y que poco con participación española y publicado también por Cell, complementarios a las investigaciones que desarrolla para
a poco desvelan su razón de ser, De la Fuente se ha fijado en donde los investigadores han desarrollado para el MASTER identificar y desarrollar el microbioma más beneficioso.
todos los pequeños marcos de lectura abierta (smORF, acróni- EU consortium una base de datos del “microbioma alimenta- Cristian Díaz-Muñoz, investigador en el Gastrointestinal
mo inglés para small open reading frame). rio” mediante la secuenciación de los metagenomas de 2.533 Genetics Lab (CIC bioGUNE – BRTA), califica la base de
“Son pedacitos [secuencias genéticas] que antes se pensaba comidas diferentes. datos desvelada como un “verdadero atlas para cualquier
que no hacían nada, que no tenían ningún tipo de función El trabajo identifica 10.899 microbios asociados a los microbiólogo y, por tanto, un punto de partida para futuras
biológica”, simplifica para explicarlo. alimentos, la mitad de los cuales eran especies desconocidas investigaciones”. En línea con De la Fuente, el investigador
“Pero al analizarlos”, añade, “descubrimos que codifican hasta ahora. del centro vasco destaca en Science Media Center (SMC)
moléculas antibióticas, que son funcionales”. Estos microorganismos asociados a los alimentos represen- España: “El vínculo entre la microbiología alimentaria y la
A partir del análisis computacional de 444.054 proteínas tan un 3% del microbioma intestinal de los adultos y el 56% del microbiota humana confirma el dicho popular de que somos
provenientes de casi 2.000 microbiomas humanos, los equipos microbioma intestinal de los bebés. lo que comemos y reafirma las bases sobre las que asentar
de la Universidad de Pensilvania y Stanford han encontrado “Este es el estudio más grande de microbios en los alimentos”, alimentos probióticos de calidad que contengan microorganis-
más de 300 candidatos con capacidad antibiótica, de los que dice el coautor y microbiólogo computacional Nicola Segata, de mos con capacidad probada de colonizar el tracto digestivo y
han seleccionado 78. El 70% de ellos funciona en cultivos de la Universidad de Trento y el Instituto Europeo de Oncología tener un efecto positivo sobre la salud intestinal”.
laboratorio y los más prometedores han mostrado eficacia en en Milán. Baltasar Mayo Pérez, profesor de Investigación del CSIC en
modelos preclínicos de ratones. “Ahora podemos comenzar a usar esta referencia para el Instituto de Productos Lácteos de Asturias, destaca a SMC
“La actividad de algunas de estas moléculas es comparable a comprender mejor cómo la calidad, la conservación, la seguri- que el trabajo “representa el mayor esfuerzo científico para
la de antibióticos existentes”, resalta. dad y otras características de los alimentos están relacionadas la caracterización microbiológica de alimentos (…) utilizando
“La molécula más favorable la hemos bautizado con el con los microbios que contienen” las técnicas de secuenciación masiva de última generación
nombre prevotelina y es producida por el microbio intestinal El equipo analizó los metagenomas asociados a los alimen- y las más avanzadas herramientas informáticas”. (El País,
Prevotella copri. Es fascinante pensar en los microbios como tos de 50 países; el 65% de fuentes lácteas, el 17% de bebidas España)