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Nuevos Protocolos de trabajo desarrollados.
Nov
en
MAL
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DITOF
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-MS.
des
Instructivo para el procesamiento rapido de hemocultivos positivos
Articulos cientificos sugeridos.
Aplicaciones post-proteómicas.
Se recomiendan los siguientes publicaciones
1- Limpiar la superficie del frasco de HC con alcohol y dejar secar.
2- Pinchar la botella de hemocultivo y transferir 5-8 gotas de la muestra a un tubo eppendorf conteniendo 300 ul de ADDD.
3- Proceder a la extracción con etanol /ácido fórmico/ acetonitrilo habitual, como se detalla:
Vortexear vigorosamente
Agregar 900 μl de EtOH (de ser necesario detener el proceso, las muestras pueden ser refrigeradas en este paso)
Vortexear vigorosamente
Centrifugar a 13000 rpm durante 2 minutos
Decantar el sobrenadante por inversión
Centrifugar a 13000 rpm durante 2 minutos
Remover el exceso de líquido con pipeta. Dejar secar a temperatura ambiente hasta evaporación total
Agregar 50 μl de AF y vortexear vigorosamente
Agregar 50 μl de AN y vortexear vigorosamente.
Centrifugar a 13000 rpm durante 2 minutos
Pipetear 1 μl del sobrenadante en un pocillo de la placa, evitando tocar el pellet.
Dejar secar
Cubrir con 1 μl de matriz. Dejar secar a temperatura ambiente 5 - 10 minutos
Introducir la placa en el equipo y proceder a la identificación en el programa MALDI BIOTYPER RTC, como cualquier aislamiento de rutina, ya que se observó que seleccionando la opción de blood culture se obtienen los mismos resultados que dejando la opción normal Project
-Weis CV et al., Machine learning for microbial identification and antimicrobial susceptibility testing on MALDI-TOF mass spectra: a systematic review, Clinical Microbiology and Infection. (2020)
https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.03.014
-Qifang Bi, Katherine E. Goodman, Joshua Kaminsky, and Justin Lessler. What Is Machine Learning: a Primer for the Epidemiologist (2019) https://doi/10.1093/aje/kwz189/5567515
-Rödel, J., Mellmann, A., Stein, C. et al. Use of MALDI-TOF mass spectrometry to detect nosocomial outbreaks of Serratia marcescens and Citrobacter freundii. Eur J Clin Microbiol Infect Dis (2019)
https://doi.org/10.1007/s10096-018-03462-2
-Centonze AR, Bertoncelli A, Savio C, Orza P, Bedenić B, Mazzariol A. Evaluation of rapid KPC carbapenemase detection method based on MALDI-TOF VITEK MS spectra analysis. J Med Microbiol. (2018)
https://doi: 10.1099/jmm.0.000831