Page 69 - Buku Ajar Biokimia 2 (Metabolisme)
P. 69
tiga enzim berbeda. Kompleks PDH mengandung tiga enzim, pyruvat dehydrogenase (E1), dihydrolipoyl transacetylase (E2), dan dihydrolipoyl dehydrogenase (E3) masing-masing terdapat dalam banyak salinan. Jumlah salinan smasing-masing enzim dan ukuran kompleks bervariasi di antara spesies. Kompleks PDH yang diisolasi dari mamalia berdiameter sekitar 50 nm, lebih dari lima kali ukuran seluruh ribosom dan cukup besar untuk divisualisasikan dengan mikroskop elektron.
Dalam enzim sapi, 60 salinan identik E2 membentuk dodekahedron pentagonal (inti) dengan diameter sekitar 25 nm. Inti dari enzim Escherichia coli mengandung 24 salinan E2. E2 adalah titik koneksi untuk gugus prostetik lipoat, yang dilekatkan melalui ikatan amida ke gugus ∈-amino dari residu Lys. E2 memiliki tiga domain yang berbeda secara fungsional: domain lipoyl terminal amino, yang mengandung residu lipoyl-Lys; domain pengikat E1 dan E3 pusat; dan domain asiltransferase inti dalam, yang berisi sisi aktif asil transferase. Kompleks PDH ragi memiliki domain lipoil tunggal dengan lipoat yang melekat, tetapi kompleks mamalia memiliki dua, dan E. coli memiliki tiga. Domain E2 dipisahkan oleh penghubung, urutan 20 hingga 30 residu asam amino, kaya akan Ala dan Pro dan diselingi dengan residu bermuatan; penghubung ini cenderung mengambil bentuk yang diperpanjang, memisahkan ketiga domain.
Gambar 25 Asam lipoat (lipoat) dalam ikatan amida dengan residu Lys.
67
