Page 95 - BUKU AJAR ASAM NUKLEAT

Proofreading pada Ribosom Aktivitas GTPase dari EF-Tu selama langkah pertama pemanjangan sel bakteri memberikan kontribusi penting pada kecepatan dan ketepatan proses biosintetik secara keseluruhan. Baik kompleks EF-Tu–GTP maupun EF-Tu–GDP ada selama beberapa milidetik sebelum terdisosiasi. Kedua interval ini memberikan peluang bagi interaksi kodon-antikodon untuk dikoreksi. Aminoasil-tRNA yang salah biasanya terdisosiasi dari sisi A selama salah satu periode ini. Jika analog GTP guanosin 5’-O-(3-thio-triphosphate) (GTP’S) digunakan sebagai pengganti GTP, hidrolisis diperlambat, meningkatkan kesetiaan (dengan meningkatkan interval proofreading) tetapi mengurangi laju sintesis protein.
Proses sintesis protein (termasuk karakteristik pasangan kodon-antikodon yang telah dijelaskan) jelas telah dioptimalkan melalui evolusi untuk menyeimbangkan persyaratan kecepatan dan ketepatan. Fidelitas yang ditingkatkan mungkin mengurangi kecepatan, sedangkan peningkatan kecepatan mungkin akan membahayakan kesetiaan. Perhatikan bahwa mekanisme proofreading pada ribosom hanya menetapkan bahwa pasangan kodon-antikodon yang tepat telah terjadi. Identitas asam amino yang melekat pada tRNA tidak diperiksa pada ribosom. Jika tRNA berhasil diaminoasilasi dengan asam amino yang salah (seperti yang dapat dilakukan secara eksperimental), asam amino yang salah ini secara efisien dimasukkan ke dalam protein sebagai respons terhadap kodon apa pun yang biasanya dikenali oleh tRNA.
Tahap 4: Pengakhiran Sintesis Polipeptida
Memerlukan Sinyal Khusus. Pemanjangan berlanjut sampai ribosom menambahkan asam amino terakhir yang dikode oleh mRNA. Pengakhiran, tahap keempat sintesis polipeptida, ditandai dengan adanya salah satu dari tiga kodon terminasi dalam mRNA (UAA, UAG, UGA), segera setelah asam amino berkode akhir.
Pada bakteri, setelah kodon terminasi menempati sisi A ribosom, tiga faktor terminasi, atau faktor release—protein RF-1, RF-2, dan RF-3—berkontribusi pada (1) hidrolisis terminal peptidil-tRNA menjalin kedekatan; (2) pelepasan polipeptida bebas dan tRNA terakhir, sekarang tidak bermuatan, dari sisi P; dan (3) disosiasi ribosom 70S menjadi
88