Page 16 - e-book molecular docking

B
2 A

B

Preparasi 2
Preparasi

Tahap awal penambatan molekul dalam penelitian ini adalah preparasi

stuktur makromolekul protein. Fungsi preparasi struktur yaitu menyiapkan
protein reseptor sebelum dilakukan docking. Hal ini diperlukan untuk

memisahkan makromolekul yang diinginkan dari ligand aslinya dan residu-
residu molekul yang tidak diinginkan. Preparasi struktur tersebut dimulai
dengan mengunduh struktur pdb makromolekul dari situs web Protein

Data Bank dengan alamat situs http://www.rcsb.ord/pbd/. Makromolekul
protein yang akan diunduh adalah protein SGLT2, dengan kode PDB 7VSI.

A. Koleksi Struktur 3D Dari Protein Target
A. Koleksi Struktur 3D Dari Protein Target

1. Mengakses struktur 3D protein SGLT2, dengan kode PDB 7VSI
pada database Protein Data Bank (PDB) (http://www.rcsb.org/).

7

Mengetik protein
kode (7VSI) pada
kolom pencarian

Tampilan website PDB

Molecular Docking 15
Molecular Docking