กล้องจุลทรรศน์ที่ใช้กันแบ่งออกเป็น 2 ประเภท คือ แบบใช้แสงธรรมดา และ แบบใช้แสงอิเล็กตรอน แบบใช้แสงธรรมดา แบบใช้แสงอิเล็กตรอน 10