Page 137 - BUKU AJAR ASAM NUKLEAT

molekul besar, dengan berat molekul sekitar 200.000 Dalton, terdiri dari sub-unit yang tidak identik. Enzim-enzim ini berbeda dari enzim dari dua kelas lainnya karena mereka membutuhkan Mg2+ dan ATP tetapi tidak SAM sebagai kofaktor. Enzim restriksi endonuklease tipe III adalah yang paling langka dari tiga jenis enzim restriksi tersebut.
Pada tahun 1968 Matthew Meselson dan Robert Yuan melaporkan bahwa mereka telah mengidentifikasi enzim dalam bakteri Escherichia coli, strain K-12, yang tampaknya mampu mengenali dan memotong DNA asing. Mereka menyimpulkan enzim ini bisa menjadi agen yang bertanggung jawab untuk restriksi. Mereka menciptakan istilah restriksi endonuklease untuk merujuk pada enzim ini. Enzim restriksi endonuklease yang ditemukan oleh Meselson dan Yuan pada E. coli membutuhkan keberadaan Mg2+, SAM, dan ATP untuk menjalankan fungsinya. Dengan demikian, enzim restriksi pertama yang diidentifikasi adalah enzim tipe I.
Tidak seperti enzim E. coli, bagaimanapun, endonuklease H. influenzae hanya membutuhkan keberadaan Mg2+ untuk aktivitasnya. Pola pembelahan kedua enzim terbatas dan dapat direproduksi secara konsisten, menunjukkan bahwa ada urutan DNA spesifik yang dikenali oleh enzim dan akan mengikat urutan ini sebelum pembelahan. Dalam makalah pendamping, Kelly dan Smith menawarkan bukti bahwa sisi pengenalan enzim adalah rangkaian enam nukleotida spesifik. Pada tahun 1975, Nathans dan Smith menyajikan nomenklatur standar yang konsisten untuk jumlah enzim yang diketahui berkembang pesat. Nama yang diberikan untuk setiap enzim baru akan menunjukkan genus dan spesies bakteri dari mana ia diisolasi, nomor regangan, dan urutan seri di mana enzim itu ditemukan. Dengan demikian, enzim restriksi yang disebut Bam HI merupakan enzim pertama yang ditemukan pada bakteri Bacillus amylloliquifaciens, strain H sedangkan enzim restriksi Hae III adalah enzim ketiga yang ditemukan pada Haemophilus aegyptius.
Kebanyakan urutan pengenalan enzim restriksi panjangnya dari empat sampai delapan basa dan kebanyakan palindromik. Keragaman tambahan ditemukan di antara isoschizomer. Sebagai contoh, enzim Sma I dan Xma I sama-sama mengenali
130