Page 90 - BUKU AJAR ASAM NUKLEAT

yang mencakup protein eIF4E, eIF4G, dan eIF4A, berikatan dengan tutup 5’ melalui eIF4E. Protein eIF4G mengikat kedua eIF4E dan PAB, efektif mengikat mereka bersama-sama. Protein eIF4A memiliki aktivitas RNA helicase. Ini adalah kompleks eIF4F yang berasosiasi dengan faktor lain, eIF3, dan dengan subunit ribosom 40S. Efisiensi translasi dipengaruhi oleh banyak sifat mRNA dan protein dalam kompleks ini, termasuk panjang saluran 3’ poli(A) (dalam banyak kasus, lebih lama lebih baik).
Inisiasi (5’)AUG terdeteksi dalam mRNA bukan oleh kedekatannya dengan urutan seperti Shine-Dalgarno tetapi dengan proses pemindaian: pemindaian mRNA dari ujung 5’ hingga AUG pertama ditemukan, menandakan awal dari kerangka baca. Kompleks eIF4F mungkin terlibat dalam proses ini, mungkin menggunakan aktivitas helikase RNA dari eIF4A untuk menghilangkan struktur sekunder pada bagian mRNA 5’ yang tidak diterjemahkan. Pemindaian juga difasilitasi oleh protein lain, eIF4B.
Tahap ketiga dari sintesis protein adalah elongasi. Sekali lagi, fokus awal penjelasan ini adalah pada sel bakteri. Pemanjangan membutuhkan (1) kompleks inisiasi yang dijelaskan di atas, (2) aminoasil-tRNA, (3) satu set tiga protein sitosol terlarut yang disebut faktor pemanjangan (EF-Tu, EF-Ts, dan EF-G pada bakteri), dan ( 4) GTP. Sel menggunakan tiga langkah untuk menambahkan setiap residu asam amino, dan langkah tersebut diulangi sebanyak residu yang akan ditambahkan.
Langkah Pemanjangan 1: Pengikatan Aminoasil-tRNA yang Masuk Pada langkah pertama siklus pemanjangan (Gbr. 61), aminoasil-tRNA yang masuk yang sesuai berikatan dengan kompleks EF-Tu yang terikat GTP. Kompleks aminoasil-tRNA-EF- Tu-GTP yang dihasilkan berikatan dengan sisi A dari kompleks inisiasi 70S. GTP dihidrolisis dan kompleks EF-Tu–GDP dilepaskan dari ribosom 70S. Kompleks EF-Tu– GTP diregenerasi dalam proses yang melibatkan EF-T dan GTP.
Elongasi Langkah 2: Pembentukan Ikatan Peptida Sebuah ikatan peptida sekarang terbentuk antara dua asam amino yang terikat oleh tRNA mereka ke sisi A dan P pada ribosom. Hal ini terjadi melalui transfer gugus N-formilme-tionil inisiasi dari tRNA-nya ke gugus amino asam amino kedua, sekarang di sisi A (Gbr.62). Gugus ∝ amino dari
83