Page 230 - BUKU AJAR BIOKIMIA 1 K5FN

mencapai 4,5 μm3 dan sitosol (spesifik gravitasi 1,20) mengandung 20 persen protein terlarut (% berat), dan jika protein terlarut tersebut terdiri semuanya dari enzim yang berbeda, hitunglah rata-rata konsentrasi molar enzim di dalam sel model ini.
5. Enzim urease meningkatkan kecepatan hidrolisis urea pada pH 8,0 dan suhu 20˚C oleh faktor 1014 . Jika sejumlah tertentu urease dapat menghidrolisa sempurna sejumlah tertentu urea dalam 5 menit pada 20˚C dan pH 8,0, berapa lamakah urea tersebut akan terhidrolisa pada keadaan yang sama, tanpa penambahan urease? Anggaplah bahwa kedua reaksi terjadi di dalam sistem steril sehingga bakteri tidk dapat mencernakan urea.
6. Sisi aktif suatu enzim biasanya terdiri pada suatu kantung pada permukaan enzim yang dilapisi oleh rantai samping asam amino yang diperlukan untuk mengikat substrat dan mengkatalisa transformasi kimia. Karboksipeptidase, yang berturut- turut melepaskan residu asam amino terminal karboksil dari substrat peptida , terdiri dari satu rantai tunggal polipeptida dengan 307 asam amino. Ketiga gugus katalitik esensialnya, yang berada pada sisi aktif diberikan oleh arginin 145, tirosin 248, dan asam glutamat 270, nomor-nomor tersebut menunjukkan letak asam amino pada deretnya.
a. Jika rantai karboksipeptidase merupakan α heliks yang sempurna, seberapa jauh jarak antara ( dalam nanometer) arginin 145 dan tirosin 248? Berapa jarak antara arginin 145 dan asam glutamat 270?
b. Jelaskanbagaimnaketigaasamaminoiniyangterpisahjauhpadasekuen, dapat mengkatalisa reaksi yang terjadi pada jarak hanya beberapa persepuluh nanometer.
c. Jika hanya ketiga gugus katalitik ini yang terlibat didalam mekanisme hidrolisis, mengapa penting bagi enzim untuk mengandung sejumlah besar residu asam amino.
227