Page 8 - e-book molecular docking
P. 8
1 B
A
B
pendahuluan 1
pendahuluan
Pengertian
Pengertian
Molecular docking merupakan simulasi secara komputasi yang
digunakan untuk mencari suatu pola interaksi antara dua molekul yang
paling tepat, yakni antara makromolekul (obat atau ligan) dan
mikromolekul (reseptor atau protein) dengan cara memasangkan obat atau
ligan pada sisi aktif dari reseptor atau protein (Pratiwi dkk, 2018). Metode
ini banyak digunakan dalam proses penemuan dan pengembangan senyawa
kandidat obat baru atau modifikasi dari obat yang sudah ada dengan tujuan
agar didapatkan aktivitas obat yang lebih baik atau untuk mengurangi efek
samping suatu obat.(Pratama dkk, 2017). Nantinya, saat proses docking
berlangsung, ligan akan menmpel pada sisi aktif protein.
Gambar 1.1 Molecular Docking (https://www.biorxiv.org/)
Tujuan dari molecular docking adalah untuk meniru peristiwa interaksi
suatu molekul ligan dengan protein targetnya yang terjadi pada saat uji in-
vitro. Prinsip docking adalah usaha untuk mencari kecocokan atau interaksi
yang terbaik antara ligan dengan reseptor• Hasil docking dikatakan baik,
apabila diperoleh interaksi dengan energi terendah•
Molecular Docking 07
Molecular Docking
