Page 44 - Modul Elektronik Bioinformatika

Ayo

Pelajari!

. Uji In Silico

Pengujian in silico yakni penambatan molekuler (moleculer docking), akan di

awali dengan analisis sifat mirip obat (drug-likeness) yang diikuti dengan

prediksi sifat fisikokimia dan farmakokinetik dan setelah itu akan dilakukan

studi doking molekuler. Berikut adalah berbagai uji yang akan dilakukan

dalam memprediksi kandidat obat dari suatu senyawa alam dengan protein

target:

.Uji Fisikokimia

Prediksi kandidat obat pada senyawa tanaman herbal dapat didasarkan

pada hukum lima Lipinski (Lipinski Rules of Five), prediksi tersebut adalah uji

sifat fisikokimia. Sifat fisikokimia memiliki beberapa parameter dalam

mengevakuasi kesamaan senyawa dengan karakter obat oral yang memiliki

aktivitas biologis pada manusia (Fikri et al. 2022). Sebelum dilakukan uji ini,

umumnya peneliti akan melakukan uji aktivitas antivirus menggunakan

website pada PASS (Prediction of Activity Spectra for Subtances) atau

hubungan antara struktur dari senyawa pilihan yang akan digunakan sebagai

ligan uji dengan aktivitas biologisnya (Sadym, A. 2003). Setelah itu, dilakukan

uji kemiripan obat menggunakan webserver lipinski of Rules Five, dimana

parameter yang akan didokumentasikan sebagai hasil ujinya antara lain,

berat molekul (<500 dalton), log P(<5), jumlah atom OH dan NH (<5), jumlah

ikatan hidrogen (<10), dan refraktivitas molar.

Gambar 5. Halaman Depan Website Lipinski Rule of Five

Modul Elektronik Bioinformatika 38