Page 41 - Bioinformatics E-Module

Ayo

Pelajari!

. Uji In Silico

Pengujian in silico yakni penambatan molekuler (docking mulecular), akan di

awali dengan analisis sifat mirip obat (drug-likeness) yang diikuti dengan prediksi sifat

fisikokimia dan farmakokinetik dan setelah itu akan dilakukan studi doking molekuler.

Berikut adalah berbagai uji yang akan dilakukan dalam memprediksi kandidat obat

dari suatu senyawa alam dengan protein target:

.Uji Fisikokimia

Prediksi kandidat obat pada senyawa tanaman herbal dapat didasarkan pada

hukum lima Lipinski (Lipinski Rules of Five), prediksi tersebut adalah uji sifat

fisikokimia. Sifat fisikokimia memiliki beberapa parameter dalam mengevakuasi

kesamaan senyawa dengan karakter obat oral yang memiliki aktivitas biologis pada

manusia (Fikri et al. 2022). Sebelum dilakukan uji ini, umumnya peneliti akan

melakukan uji aktivitas antivirus menggunakan website pada PASS (Prediction of

Activity Spectra for Subtances) atau hubungan antara struktur dari senyawa pilihan

yang akan digunakan sebagai ligan uji dengan aktivitas biologisnya (Sadym, A. 2003).

Setelah itu, dilakukan uji kemiripan obat menggunakan webserver lipinski of Rules

Five, dimana parameter yang akan didokumentasikan sebagai hasil ujinya antara lain,

berat molekul (<500 dalton), log P(<5), jumlah atom OH dan NH (<5), jumlah ikatan

hidrogen (<10), dan refraktivitas molar.

Gambar 5. Halaman Depan Website Lipinski Rule of Five

Modul Elektronik Bioinformatika 36