Page 26 - BUKU AJAR ASAM NUKLEAT

1) Struktur Heliks tangan kanan a. Struktur A-DNA
DNA bentuk-A pertama kali diidentifikasi dari studi difraksi serat DNA pada kelembaban relatif 'rendah' (75%). Baru-baru ini, studi kristal telah mengidentifikasi urutan spesifik yang dapat mengadopsi jenis struktur A-DNA (Gambar 15b). Secara umum, A-DNA untuk sekuens apa pun disukai di bawah kondisi dehidrasi, dan peregangan purin tertentu akan mendukung konformasi-A, bahkan dalam kasus tingkat hidrasi yang lebih tinggi. Tampaknya setidaknya empat purin (atau pirimidin) berturut-turut cukup untuk membentuk heliks A-DNA lokal, meskipun tentu saja peregangan purin tertentu lebih cenderung membentuk A-DNA daripada yang lain. (Misalnya, urutan AAAA mengkristal sebagai B-DNA, bukan dalam heliks-A.) Dengan demikian, dimungkinkan untuk memiliki urutan DNA yang berisi beberapa daerah dalam bentuk-A dalam konteks terutama konformasi-B.
Heliks A-DNA sedikit lebih lebar dari B-DNA (dan juga Z-DNA), dan ini terutama disebabkan oleh fakta bahwa pasangan basa menumpuk hampir di atas satu sama lain dalam B-DNA, tetapi menumpuk sedikit di luar pusat dalam konformasi-A. Perhatikan pada Gambar 15b bahwa, jika anda melihat ke bawah heliks, ada lubang di konformasi A, yang tidak ada di dua konformasi heliks lainnya.
Gambar 15 Pandangan yang berbeda dari heliks DNA
19