Page 103 - BUKU AJAR BIOKIMIA 1 K5FN

Catatan: *Nilai Mr mencerminkan struktur seperti yang ditunjukkan pada tabel5. Unsur-unsur air (Mr 18) dihilangkan ketika asam amino dimasukkan ke dalam polipeptida. Indeks hidropati adalah skala yang menggabungkan hidrofobisitas dan hidrofilisitas gugus R. Nilai tersebut mencerminkan energi bebas (∆G) transfer rantai samping asam amino dari pelarut hidrofobik ke air. Transfer ini menguntungkan (∆G, < 0; nilai negatif dalam indeks) untuk rantai samping asam amino bermuatan atau polar, dan tidak menguntungkan (∆G > 0; nilai positif dalam indeks) untuk asam amino dengan rantai samping nonpolar atau lebih hidrofobik.
Jika protein di hidrolisis dengan basa kuat, asam amino unit pembangunnya dapat dibebaskan dari ikatan kovalen yang menghubungkan molekul ini dari rantai polipeptidanya. Asam amino yang terbentuk merupakan molekul yang relatif kecil dan struktur masing-masing sudah diketahui.
Ciri-ciri asam amino:
1. Semua asam amino mempunyai gugus karboksil dan gugus amino pada atom ”C 𝛼𝛼” yang sama.
R merupakan gugus alkil.
2. Semua asam amino kecuali glysin memiliki atom C asimetris, oleh karenanya semua asam amino kecuali glysin mempunyai pusat kiral. Senyawa dengan pusat kiral terdapat dalam bentuk isomer yang berbeda, yang bersifat identik dalam semua sifat kimia dan fisiknya, kecuali satu yakni arah perputaran sinar terpolarisasi di dalam polarimeter.
3. Semua asam amino pembentuk protein mempunyai konfigurasi absolut “L”. Konfigurasi ini dibandingkan dengan senyawa pembanding L Gliseraldehida.
100