Page 171 - BUKU AJAR ASAM NUKLEAT

Enzim restriksi endonuklease dapat digunakan dalam proses ini untuk mendapatkan fragmen DNA yang di inginkan. Setiap enzim restriksi memotong DNA pada urutan basa tertentu, yang disebut urutan pengenalan, yang dapat divariasikan dari 4 menjadi 16 atau 20 pasangan basa. Jika kita mendalilkan bahwa pengenalan DNA didistribusikan secara acak dalam molekul DNA, maka kita dapat menghitung berapa banyak enzim memotong molekul DNA. Suatu pengertian yang penting harus diketahui, yaitu bahwa untuk setiap posisi molekul DNA terdapat empat kemungkinan, (A, C, G, atau T). Oleh karena itu, enzim restriksi yang mengenali urutan empat nukleotida, mereka akan memotong sekali per masing-masing 256 bps (atau 44). Enzim lain yang mengenali enam urutan nukleotida, dapat memotong sekali per masing-masing 4096 bps (atau 46). Setelah identitas enzim restriksi diketahui, maka harus diketahui bagaimana enzim restriksi mengidentifikasi sekuens pengenalan yang tersedia pada DNA untuk memotongnya. Jadi bagaimana enzim menemukan urutan pengenalannya? Sebagian besar enzim restriksi mengenali dan memotong sekuens DNA palindrom. Urutan ini mewakili substrat yang terkena serangan oleh restriksi endonuklease.
Gambar 104 Pemotongan gen dengan enzim restriksi
164