Page 174 - BUKU AJAR BIOKIMIA 1 K5FN

satu dengan residu asam amino 4 membentuk struktur 𝛼𝛼-Heliks. Pola ikatan ini menarik rantai polipeptida menjadi struktur heliks yang menyerupai pita melengkung, dengan setiap putaran heliks mengandung 3,6 residu asam amino. Gugus R asam amino menonjol keluar dari heliks, dan bebas berinteraksi.
Dalam bentuk β-sheet, dua atau lebih segmen rantai polipeptida berbaris di samping satu sama lain, membentuk struktur seperti lembaran yang disatukan oleh ikatan hidrogen. Ikatan hidrogen terbentuk antara gugus karbonil dan amino pada tulang punggung, sedangkan gugus R memanjang di atas dan di bawah bidang lembaran. Untaian lembaran mungkin paralel, menunjuk ke arah yang sama (artinya N- dan C-terminal mereka cocok), atau antiparalel, menunjuk ke arah yang berlawanan (artinya N-terminal dari satu untai diposisikan berikutnya ke terminal-C yang lain).
Struktur ∝ Helix
• Tulang punggung heliks disatukan oleh ikatan hidrogen antara amida tulang
punggung dari n dan n+4 asam amino.
• Heliks tangan kanan dengan 3,6 residu (5,4 A) per putaran.
• Ikatan peptida disejajarkan dengan sumbu heliks.
• Rantai samping kira-kira tegak lurus dengan sumbu heliks.
Ada metode sederhana untuk menentukan apakah struktur heliks adalah tangan kanan atau tangan kiri. Kepalkan kedua tangan Anda dengan ibu jari terentang dan mengarah menjauh dari Anda. Melihat tangan kanan Anda, pikirkan sebuah heliks yang melingkari ibu jari kanan anda ke arah di mana keempat jari lainnya melengkung seperti yang ditunjukkan (searah jarum jam). Heliks yang dihasilkan adalah tangan kanan. Tangan kiri anda akan menunjukkan heliks tangan kiri, yang berputar berlawanan arah jarum jam saat memutar ibu jari anda.
171