Page 59 - MODUL Analisis Insilico Senyawa Organolsulfur BPT sebagai anti hipertensi (sistem kardiovaskular)
P. 59
dithiin di tandai dengan warna green, 3 vinyl 1 2 dithiacyclohex 4 ene di tandai dengan lime green, 4 methyl 5
vinylthiazole di tandai dengan warna blue, Allyl methyl trisilfide di tandai dengan ungu , Allyl propyl disulfide
di tandai dengan kuning , E 1 propenil allyl disulfide di tandai dengan warna blue dan senyawa kontrol
Deoxyaliindi tandai dengan black
(Sumber: Koleksi Pribadi)
Hasil docking molekuler dapat divisualisasikan menggunakan software Discovery
Studio. Visualisasi dilakukan untuk mengetahui interaksi antara ligan dan makromolekul
serta mengetahui residu asam amino. Amino residu asam dari fiksasi senyawa aktif bawang
putih tunggal dan obat pengontrol deoxyaliin pada enzim 3OOT Chin A adalah disajikan
pada Tabel 3.
TABEL 3. Jenis dan jarak ikatan antara ligan dan residu asam amino protein target
Conventional Alkyl Bond Pi-sigma Bond Pi-alkyl Bond
Ligan hydrogen bond
Residu asam amino Residu asam Residu asam amino Residu asam amino
amino
1,2 ASP A: 32 Val A: 120
Dimercaptocy
clopentane
2 3 4 Val A : 120 Tyr A:75 Phe A 112
trithiapentane Val A ; 30
2 propenyl 1 Val A : 120 Phe A 112
propenyl Val A ; 30 Trp A 39
Phe A 117
2 vinyl 4H 1 Val A 120 Phe A 112
3 dithiin Tyr A 75
3 vinyl 1 2 Thr A 77 Val A : 120 Tyr A 75
dithiacyclohe Val A ; 30
x 4 ene
Allyl_methyl Val A 120 Phe A 112
_trisulfide Tyr A 75
Trp A 39
Allyl_propyl_ Val A : 120 Tyr A:75 Phe A 112
disulfide Val A ; 30 Phe A 117
Trp A 39
E 1 propenil Thr A 77 Val A : 120 Tyr A:75 Phe A 112
allyl disulfide Val A ; 30 Phe A 117
Trp A 39
Deoxyaliin ASP A: 32 Val A 120 Tyr A:75 Phe A 112
Trp A 39
Hasil visualisasi molekuler docking menunjukkan bahwa senyawa aktif dan obat
pengontrol Deoxyaliin berada di satu situs pengikatan pada enzim, dan dapat di ketahui
senyawa tersebut memiliki beberapa sisi fiksasi asam amino yang sama. Prediksi nilai sifat
fisikokimia senyawa aktif bawang putih tunggal dan senyawa kontrol deoxyaliin yang
diperoleh dari website online PubChem dan pkCSM disajikan pada tabel 4.
11
