Page 50 - MODUL Analisis Insilico Senyawa Organolsulfur BPT sebagai anti hipertensi (sistem kardiovaskular)

kondisi atau keadaan nyata ke dalam simulasi komputer dengan menggunakan program

tertentu. Terminologi in silico, analog dengan in vitro dan in vivo merujuk pada
pemanfaatan komputer dalam studi penemuaan obat, sebagaimana diketahui dalam proses

penemuan obat membutuhkan waktu yang sangat lama dan biaya yang mahal, oleh karena

itu kecenderungan dalam penggunaan metode in silico pada kimia komputasi dalam
pemodelan molekul (desain obat) telah memperoleh momentum yang signifikan

(Geldenhuys, 2006). Docking molekul merupakan suatu metode komputasi yang
digunakan untuk memasangkan suatu molekul kecil (ligan) pada bagian sisi aktif dari

enzim (reseptor) dan menggambarkan interaksi dari yang terjadi. Docking sering
digunakan untuk memprediksi orientasi pengikatan molekul kecil calon obat dengan target

proteinnya, memprediksi afinitas dan aktivitas dari molekul kecil serta melihat geometri

tiga dimensi dari senyawa yang terikat pada sisi aktif protein. Oleh karena itu, docking
berperan penting dalam desain obat rasional Jantung diatur oleh dua cabang saraf, sistem

saraf otonom: simpatis atau adrenergik dan parasimpatis atau kolinergik.

Bioinformatika mempunyai tiga platform dasar dalam melakukan sebuah penelitian,

diantaranya adalah pangkalan data biologi yang diakses secara daring (database), analisis

prediksi fenomena biologis, baik secara struktural maupun fungsional secara daring (web
server) dan perangkat lunak yang digunakan untuk analisis secara luring dengan fungsi

spesifik (software). Database, web server, dan software yang digunakan dalam penelitian

ini diantaranya adalah:

1. Pubchem adalah database senyawa kimia bahan alam maupun sintetik. Database ini
diluncurkan sejak tahun 2004 oleh National Institute of Health (NIH) dan berperaan

penting dalam kegiatan penyimpanan informasi senyawa kimia dan potensi

biologisnya. Database ini digunakan dalam penelitian penemuan obat, biokimia,
kimia medis, dan lain-lain (Kim et al., 2016). PubChem digunakan sebagai langkah

awal dalam penelitian obat atau terkait potensi senyawa bahan alam secara in silico.
Sampel yang telah mengalami preparasi dari PubChem dapat digunakan untuk uji

lanjutan dalam analisis in silico seperti prediksi jalur biologis, gambaran umum

terkait potensi, dan molecular docking. Peneliti biasanya mengambil informasi

2