Page 52 - MODUL Analisis Insilico Senyawa Organolsulfur BPT sebagai anti hipertensi (sistem kardiovaskular)
P. 52

lipofilisitas  atau  LogP  kurang  dari  5,  jumlah  ikatan  hidrogen  donor  dan  akseptor
                           masing-masing kurang dari 5 dan 10, serta reaktivitas molar harus antara 40 dan130

                           (Lipinski, 2004). (Link: scfbioiitd.res.in/software/drugdesign/Lipinski.jsp).
                        7. Toxtree, adalah  software  untuk menilai risiko dan bahaya suatu senyawa. Toxtree

                           menerapkan aturan fisikokimia dan struktural untuk menganalisis sifat dan struktur
                           senyawa, menggunakan pendekatan tree approach untuk menetapkan kelas Cramer

                           (I, II, dan III). Setiap kelas  memiliki ambang  masalah toksikologi (TTC), paparan

                           manusia  dalam  mikrogram/hari.  Membandingkan  TTC  senyawa  dengan  tingkat
                           paparan aktual diprediksi menunjukkan apakah tingkat risikonya dapat diterima atau

                           tidak. ToxTree juga memprediksi potensi iritasi kulit dan iritasi mata, mutagenisitas/

                           karsinogenisitas,  biodegradasi,  sensitisasi  kulit  dan  karakteristik  lainnya.  (Link:
                           toxtree.sourceforge.net).

                        8. Protein  Data  Bank  (PDB;  http://www.rcsb.org/pdb/)  merupakan  database  yang
                           memiliki  lebih  dari  32.500  struktur  tiga  dimensi  dari  makromolekul  biologis

                           termasuk protein dan asam nukleat. Makromolekul pada  database PDB merupakan
                           molekul yang ditemukan pada semua organisme termasuk  manusia, bakteri, hewan

                           dan tanaman. Struktur yang terdapat dalam PDB mulai dari protein yang kecil dan

                           potongan-potongan  DNA  sampai  molekul  kompleks  seperti  ribosom  (Fatchiyah,
                           2014). Molekul protein yang didapatkan dari PDB akan digunakan sebagai reseptor

                           dalam proses docking (Fatchiyah, 2014).
                        9. Lipinski  Rule  of  Five  (RO5)  (scfbio-iitd.res.in/software/drugdesign/lipinski.jsp)

                           merupakan sebuah server  yang digunakan untuk memprediksi keaktifan suatu obat
                           atau  senyawa  kimia  ketika  diberikan  secara  oral  pada  manusia  (Lesk,  2014).

                           Reseptor  yang  digunakan  dalam  penelitian  berada  dalam  sel  sehingga  ligan  harus

                           memiliki  kemampuan  untuk  menembus  membran  sel  agar  dapat  berikatan  dengan
                           reseptor  targetnya  (Lesk,  2014).  Pengecekan  prinsip  Lipinski’s  Rule  of  Five  akan

                           membantu untuk menentukan kemampuan bioavailabilitas dari ligan yang berikatan

                           dengan reseptornya (Lesk, 2014).
                        10.  Uji  ADMET  merupakan  suatu tes  yang  dilakukan  untuk  mengidentifikasi  sifat

                           farmakokinetik dari suatu senyawa yang meliputi Absorption (penyerapan),



                                                              4
   47   48   49   50   51   52   53   54   55   56   57