Page 549 - Chimie organique - cours de Pau 2- Brigitte Jamart

Partie Il ■ Chimie organique descriptive

En outre, certaines protéines, dites « protéines conjuguées » comportent, indépendamment de la
chaîne peptidique habituelle, un groupe de nature totalement différente, appelé « groupe prosthé-
p tique ». C'est le cas, par exemple, des nucléoprotéines présentes dans le noyau des cellules, dont le
groupe prosthétique est un acide nucléique. Les vitamines constituent parfois le groupe prosthétique
§ 22.4.3.b de protéines conjuguées.
Bien que le nombre de types différents d'aminoacides entrant dans la constitution des protéines
soit restreint (une vingtaine d'aminoacides courants, regroupés dans le tableau 23.1, et quelques
dizaines d'autres beaucoup plus rares), la diversité des protéines est pratiquement infinie, compte tenu
du très grand nombre d'arrangements possibles de ces motifs élémentaires. Pour un polypeptide
formé par la condensation de dix molécules d'aminoacides toutes différentes, le nombre d'arrange-
ments possibles est (10!)= 3 628 000. Le nombre d'arrangements pour une protéine correspondant à
plusieurs centaines d'aminoacides de 15 ou 20 types différents (cas le plus fréquent) est inimaginable
et ceci permet de comprendre que, malgré la faible diversité des matériaux de base, chaque espèce et
même chaque individu peut avoir ses protéines spécifiques.

Chaque organisme individuel édifie ses propres protéines à partir de celles qui se trouvent dans ses ali-
ments, préalablement dégradées au cours de la digestion en acides aminés, qui sont ensuite recondensés
en nombre et dans l'ordre voulus.
En définitive, la source unique de protéines est constituée par les plantes qui, seules, sont capables d'en
faire la synthèse à partir de CO, et H,O de l'atmosphère et de l'azote du sol (Photosynthèse).

2 La synthèse peptidique sur support solide

§ 23.2.2 ~ synthèse peptidique classique, bien qu'effi- réactif peut être utilisé pour rendre les réac-
cace pour la préparation de peptides de petites tions rapides et totales, l'excès étant facile-
tailles, n'est plus utilisable pour la synthèse ment éliminé.
d'enchaînements plus longs. En effet, en plus En fin de synthèse, le peptide est décroché du
des problèmes de faible solubilité des peptides support solide et est purifié. Cependant, en
contenant plus de l O résidus, les purifications utilisant cette technique et compte tenu de
nécessaires à chaque étape sont fastidieuses et l'absence de purification intermédiaire, les
peuvent entraîner des problèmes de racémisa- rendements de chaque étape doivent être les
tion des centres chiraux. plus élevés possibles. Par exemple, pour la
Depuis le milieu des années soixante, une synthèse d'une ribonucléase de l 23 acides
amélioration importante de la méthode a été aminés, l 22 réactions de couplages (forma-
apportée (notamment par Merrifield, prix tion de la fonction amide) sont nécessaires ; si
Nobel 1984) en fixant la chaîne peptidique en le rendement de couplage est de 99 %, ce qui
croissance sur un polymère insoluble (généra- constitue un rendement excellent, le rende-
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lement du polystyrène). Cette technique, ment final sera de 0,99 22_ 27 %. Le peptide
appelée Synthèse Peptidique sur Support sera donc accompagné de 73 % de peptides
Solide, permet la préparation aisée et rapide plus courts qu'il faudra éliminer lors de la
de peptides de longues tailles voire même de purification.
petites protéines. Ainsi, les étapes longues et Cette technique de synthèse sur support solide
délicates de purification sont remplacées par est également utilisée de façon plus générale
des lavages de la résine permettant une élimi- pour réaliser des réactions autres que des réac-
nation rapide de tous les sous produits ou tions peptidiques ; on parle alors de Synthèse
réactif en excès non fixés sur le polymère. Organique sur Support Solide.
Dans ce type de méthode, un gros excès de

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