Page 551 - Chimie organique - cours de Pau 2- Brigitte Jamart

Partie Il ■ Chimie organique descriptive

Quelques exemples

H,C CH,CH,
/
CH, CH,CH, CH (CH),NH,
1 1 1 1
H N-CH -CO -NH-CH-COOH H N-CH-CO-NH-CH-CO-NH-CH-COOH
2 2 2
H-Gly-Ala-OH H-Phe-lle-Lys-OH

23.2.2 Synthèse peptidique et synthèse de protéine

Le principe de la synthèse peptidique repose sur l'enchaînement des aminoacides dans un ordre déter-
miné par création de liaisons amide entre une fonction acide carboxylique d'un partenaire et une
fonction amine d'un autre partenaire. Pour obtenir un arrangement déterminé, il faut procéder par
étape et introduire les aminoacides les uns après les autres. Il s'agit d'une entreprise très difficile et
délicate et ce pour plusieurs raisons :
• les acides aminés sont des composants plurifonctionnels ; aussi, lors de la formation d'une liaison
amide, tous les autres groupes fonctionnels devront être protégés. Cependant, l'élongation ulté-
rieure de la chaîne peptidique nécessitera la déprotection sélective d'une de ces extrémités (l' extré-
mité aminée) en laissant intacts les autres groupes protecteurs des chaînes latérales et de la fonction
acide carboxylique terminale.
• tous les acides (sauf la glycine) sont porteurs d'au moins un atome de carbone asymétrique; les
conditions réactionnelles utilisées devront éviter toute racémisation (éviter le milieu acide ou
basique fort).
• la fonction acide carboxylique d'un acide aminé n'est pas assez réactive pour réagir directement
avec une fonction amine dans des conditions douces : une activation de la fonction acide est donc
nécessaire.

Exemple de la synthèse d'un tripeptide :
L'extension de la chaîne peptidique se fait de la droite vers la gauche (de l'extrémité C-terminale
vers l'extrémité N-terminale). A = groupe activant P = groupe protecteur temporaire (fonction amine)
pn groupe protecteur permanent (chaînes latérales)

""
HN AA')C "-.oR 2
,--L:
couplage 1 l P- HN ~c /0
O A
p2 Il pl 0
a-@ "-.oR

Déprotection O l
usa-ms 0
j
pl
OR

couplage 2 l PIN@@C
1 "
0 0 A
Ni i »
HN~C -HN ~C -HN~C,
P / OR
Déprotection finale l
0 0
0
Il 11 /
N-a@D c @DO C-IN-AD
OH
530